งานวิจัยชิ้นนี้เป็นการศึกษาอันตรกิริยาของสารอนุพันธ์ไพราซิโนนที่มีผลต่อการยับยั้งเอนไซม์การถ่ายแบบเอช ไอ วี -1 จำนวน 24 โมเลกุล โดยศึกษาการวางตัวของอนุพันธ์ไพราซิโนนในโพรงการจับเอนไซม์การถ่ายแบบเอช ไอ วี -1 ด้วยวิธีโมเลคิวลาร์ด็อกกิ้ง โดยโครงสร้างเริ่มต้นของอนุพันธ์ไพราซิโนน ได้คำนวณทางเคมีควอนตัมด้วยระเบียบวิธี แอบอินิชิโอ (HF/3-21G) และโครงสร้างเริ่มต้นของเอนไซม์ได้คัดเลือกจากProtein Data Bank (รหัส 1SUQ) แล้วทำการคำนวณค่าพลังงานการจับระหว่างโครงสร้างของอนุพันธ์ไพราซิโนนทั้ง 24 โครงสร้างเข้าไปในโพรงการจับของเอนไซม์การถ่ายแบบเอช ไอ วี -1 โดยโปรแกรมออโตด็อก 3.05 ผลการศึกษาพบว่า ค่าพลังงานการจับมีค่าอยู่ในช่วง -16.87 kcal/mol ถึง -14.20kcal/mol นอกจากนั้นการวางตัวของอนุพันธ์ไพราซิโนนในโพรงการจับ มีอันตรกิริยาที่สำคัญ คือ อันตรกิริยาที่เกิดจากพันธะไฮโดรเจนระหว่างไพราซิโนน กับ Lys101, Lys103, Tyr188, His235 และ Pro236 และอันตรกิริยาไพ-ไพ ระหว่างวงฟีนิลของไพราซิโนน กับ Tyr181 ----------------------------------------------------------- Investigation on molecular interaction between twenty-four pyrazinone derivatives and the binding pocket of HIV-1 reverse transcriptase (HIV-1 RT) were studied by Molecular Docking Calculations. The initial structures of pyrazinone derivatives were calculated by ab initio quantum chemical method(HF/3-21G). Structure of HIV-1 RT was taken form Protein Data Bank (PDB code 1SUQ). All pyrazinone derivatives were docked into the binding pocket of HIV-1 RT using Autodock3.05 program. The obtained results showed that final docked energies were ranged between -16.87 kcal/mol to -14.20 kcal/mol. The important interactions between pyrazinone derivatives and HIV-1 RT binding pocket were found to be H-bonding with Lys101, Lys103, Tyr188, His235 and Pro236 and ¶-¶ interaction between phenyl ring of pyrazinone and Tyr181.
สถาบันส่งเสริมการสอนวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี (สสวท.) กระทรวงศึกษาธิการ เป็นหน่วยงานของรัฐที่ไม่แสวงหากำไร ได้จัดทำเว็บไซต์คลังความรู้ SciMath เพื่อส่งเสริมการสอนวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์และเทคโนโลยีทุกระดับการศึกษา โดยเน้นการศึกษาขั้นพื้นฐานเป็นหลัก หากท่านพบว่ามีข้อมูลหรือเนื้อหาใด ๆ ที่ละเมิดทรัพย์สินทางปัญญาปรากฏอยู่ในเว็บไซต์ โปรดแจ้งให้ทราบเพื่อดำเนินการแก้ปัญหาดังกล่าวโดยเร็วที่สุด
The Institute for the Promotion of Teaching Science and Technology (IPST), Ministry of Education, a non-profit organization under the Thai government, developed SciMath as a website that provides educational resources in Science, Mathematics and Technology. IPST invites visitors to use its online resources for personal, educational and other non-commercial purpose. If there are any problems, please contact us immediately.
Copyright © 2018 SCIMATH :: คลังความรู้ SciMath. Terms and Conditions. Privacy. , All Rights Reserved.
อีเมล: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. (ให้บริการในวันและเวลาราชการเท่านั้น)