การพัฒนา RNA ที่สามารถยึดจับนิกเกิลเพื่อใช้เป็น affinity tag สำหรับการทำ ribonucleoprotein ให้บริสุทธิ์
ในการพัฒนา RNA affinity tag สำหรับใช้ในการทำ ribonucleoprotein ให้บริสุทธิ์นั้น RNA ligands หรือ aptamers ที่ถูกคัดเลือกจาก random RNA library มีความสามารถในการยึดจับกับนิกเกิลและถูกล้างออกด้วยimidazole aptamerที่ได้หลังจากการคัดเลือกรอบที่12 มีการยึดจับกับนิกเกิลเป็นอย่างดี และพบว่ามีadenineมากในลำดับเบส ซึ่งมีงานวิจัยก่อนหน้านี้แสดงความสัมพันธ์ของเบสชนิดนี้ในการยึดจับนิกเกิล aptamersที่ได้จากงานวิจัยนี้สามารถนำไปใช้ประโยชน์ในการเป็น RNA affinity tag ที่มีความจำเพาะกับนิกเกิล --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Abstract: To develop a novel RNA affinity tag for purification of ribonucleoprotein complexes, RNA ligands or aptamers capable of binding to nickel-nitriloacetate (Ni-NTA) beads and being eluted with imidazole were selected from a random RNA library. After 12 rounds of in vitro selection, the desired aptamers were highly enriched and showed strong binding toward Ni-NTA. Their sequences were adenine rich, forming stretches of ~ 5-15 consecutive A’s; interestingly, this purine base has previously been implicated in binding to Ni2+. Subsequent works are under way to evaluate the usefulness of these nickelspecific aptamers as an RNA affinity tag.
-
6039 การพัฒนา RNA ที่สามารถยึดจับนิกเกิลเพื่อใช้เป็น affinity tag สำหรับการทำ ribonucleoprotein ให้บริสุทธิ์ /project-other/item/6039-rna-affinity-tag-ribonucleoproteinเพิ่มในรายการโปรด